| 张勇.水稻基因组MSAP指纹图谱构建及DNA甲基化修饰位点分离与鉴定[J].高技术通讯(中文),2009,19(9):983~990 |
| 水稻基因组MSAP指纹图谱构建及DNA甲基化修饰位点分离与鉴定 |
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| DOI： |
| 中文关键词: 水稻， 表观遗传， DNA甲基化， 甲基化敏感扩增多态性(MSAP)， CpG岛 |
| 英文关键词: |
| 基金项目: |
| 作者 | 单位 | | 张勇 | 电子科技大学生命科学与技术学院；四川农业大学植物遗传育种省级重点实验室 |
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| 中文摘要: |
| 采用EcoR I和Hpa II/Msp I双酶切建立了适合于水稻基因组的甲基化敏感扩增多态性（MSAP）分析体系，在全基因组水平检测了水稻DNA甲基化修饰位点。以12对MSAP引物进行选择性扩增，共检测到甲基化修饰位点120个，“CCGG/GGCC”位点甲基化修饰比例为20.17%。对部分水稻基因组甲基化修饰位点进行回收，最终分离了55条存在甲基化位点变异的DNA序列，通过BLAST比对分析将其联配到水稻基因组序列上。分析表明，这些甲基化修饰位点主要集中于基因启动子区（47%）和第一外显子区（22%），在其侧翼序列中存在类似“CpG island” 典型序列特征的“CpG”二核苷酸成簇富集区。在此基础上，对应用MSAP技术分离水稻基因组DNA甲基化修饰位点的有效性以及水稻基因组序列中“CpG island”类似序列分布特征和生物意义进行了讨论。 |
| 英文摘要: |
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